Hondō, hall principal
Le magnifique bâtiment principal du temple Rinnō-ji est également connu sous le nom de hall des trois bouddhas. Les Trois bouddhas sont Amida Nyōrai, Senjū Kannon et Batō Kannon.
La statue à droite est Senjū Kannon, la déesse de la miséricorde, dont chacune des mille mains tient un outil représentant l’une de ses nombreuses capacités pour aider l'humanité à atteindre l'illumination. Au milieu se trouve Amida Nyōrai, le Bouddha de la lumière et de la vie infinies. Sur la gauche se trouve Batō Kannon, le Bouddha à tête de cheval. Le cheval représente le pouvoir et, malgré son expression coléreuse, Batō Kannon est considéré comme un gentil Bouddha. Au Rinnō-ji, ces trois bouddhas sont consacrés comme un seul groupe, où chacun deux est la manifestation différente d'un seul et même sens. Les trois bouddhas sont identifiés aux trois montagnes de Nikkō : Senjū Kannon est le mont Nantai, Amida Nyōrai, le mont Nyoho et Batō Kannon représente le mont Taro.
Le hall fut construit pour la première fois en 848 EC par le moine Ennin (vers 794 - 864), un grand prêtre de la secte bouddhiste Tendai, qui fut introduite au Japon depuis la Chine en 806. Le bouddhisme Tendai est l'une des écoles les plus influentes, complètes et diversifiées du bouddhisme japonais. Le bouddhisme Tendai incorpore les enseignements d'autres écoles de bouddhisme et réconcilie également les enseignements bouddhistes avec le shintō. Le hall principal était d’abord situé à l'endroit où se trouve aujourd'hui le sanctuaire de Tōshō-gū et fut déplacé et reconstruit à plusieurs reprises. La structure actuelle date de 1645.
Quand Edo (Tokyo) devint le centre de la politique japonaise sous le shogunat Tokugawa en 1603, la famille Tokugawa, alors au pouvoir, chercha à construire une nouvelle capitale pour rivaliser avec la grandeur de Kyoto, qui avait été le siège de la politique et de la culture japonaise pendant près d'un millénaire. À cette fin, le troisième shogun Tokugawa, Iemitsu, ordonna la construction du plus grand et magnifique hall principal du pays à Rinnō-ji. Le hall principal ne put malheureusement pas atteindre cet objectif par manque de ressources, bien que le bâtiment ait été le plus grand à l'est de Kyoto.